Обязательно ли в программе создавать папки по уровням: стройка и объект?

Нет на данный момент, можно задавать папки произвольно. Наименование папки, не отразиться на печатной форме локальных и объектных смет. В свойства локальной сметы или папки можно внести наименование объекта и стройки без дополнительных папок.